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Débat du mois : l'emploi au féminin

Evelyne Duvernois — Fri, 26 Sep 2008 13:53:00 +0200

Voilà, le débat du mois est lancé. J'ai mis un peu de temps à publier mon "expertise". Cela valait-il le coup ? Vous me le direz après m'avoir lu !
Après Nathalie, Véronique, Marie, Patricia, Seb, Sylvain et Sylve, c'est enfin mon tour !

Pour parler d'emploi au féminin, je pense qu'il faut déjà parler d'emploi tout court... Selon les dictionnaires en tout genre, un emploi correspond à un contrat entre 2 parties, un employeur et un employé, pour réaliser un travail contre rémunération.

Il n'y a donc pas de "genre masculin/féminin" là dedans.
On ne distingue pas "emploi au féminin" et "emploi au masculin"...
Alors pourquoi débattons-nous aujourd'hui ? Tentons une explication dans le milieu qui me caractérise le plus : la recherche française et le monde de la bioinformatique !

Alors alors c'est parti, vous cherchez un emploi dans la recherche. Vous êtes technicienne, ingénieur (et même ingénieuse) ou chercheuse, vous êtes surtout une femme ! Telle est l'épée de Damoclès qui vous est tombée dessus dès votre naissance : être une femme dans la recherche française, ce n'est pas de tout repos !

Vous sortez des études en biologie, chimie, physique... et vous voulez percer dans le milieu de la recherche. En tant que "jeune femme et jeune active", vous cumulez un peu les mauvais points. Nombreux sont les milieux professionnel où les femmes sont encore mal perçues : une femme c'est forcément bavard, ce n'est pas assez productif, c'est une faible chose et pour peut que ça soit une blonde... Non j'exagère un peu là !

En ce moment dans la recherche, les emplois ne sont pas simples à trouver, mais c'est le lot de tout le monde, garçon ou fille. Tout dépend le milieu dans lequel vous cherches. Je vais m'attarder un peu plus sur le milieu que je connais le mieux : la bioinformatique !

Une femme bioinformaticienne

Il est vrai que la bioinformatique n'est pas encore un milieu très "féminin". Le terme "informatique" fait penser qu'on programme toute la journée, qu'on est enfermé dans une sorte de grotte souterraine, sans lumière, sans visite, sans vie sociale. Bref, en tant que bioinformaticienne, nous sommes forcément des garçons manqués pour souhaiter faire ce travail ! Et bien que nenni, cher lecteur. La bioinformatique est un monde d'échange, de collaboration, où toute femme et tout homme a sa place.

Jusqu'à présent, ma "qualité" de femme n'a jamais été un problème. Mon chef actuel n'a aucun préjugé et préfère les qualités d'un candidat à son apparence. Je remplace d'ailleurs une autre femme à mon poste. Mes collègues sont des hommes ET des femmes, en nombre équivalent. J'ai toujours été bien accueillie dans mes emplois et stages, mes idées sont écoutées, prises en compte, étudiées. De même durant mes études, filles et garçons s'entendaient bien et l'entre-aide était de rigueur (oui je sais, j'ai fait une super formation avec des gens supers). Bref, on ne peut pas vraiment dire que mon environnement de travail soit le plus mauvais pour une femme.

Les avantages d'être une femme en bioinformatique :

Depuis que le femmes travaillent (déjà 60 ans et des brouettes, pour la majorité...), pleins de choses se sont dites sur le travail des femmes, et pas toujours très élégantes ! Je pense moi qu'une femme apporte un peu de "douceur à ce monde de bruts" et surtout je pense qu'une femme a sa place dans n'importe quel milieu professionnel.
En bioinformatique, les femmes sont de plus en plus nombreuses. On ne voit plus d'hommes informaticiens isolés dans leur bureau, enfin si, encore un peu, mais ça évolue. La bioinformatique est un de ces métiers qui, je pense, permet d'intégrer un individu à une équipe, qu'il soit homme ou femme. En effet, notre condition même de bioinformaticiens imposent une vision large du travail : nous partageons, nous échangeons, puisque notre travail est pluri-disicplinaire. Peut-être est-ce justement ce côté pluri-disciplinaire qui fait que la bioinformatique est un monde ouvert à tous ?
Je ne sais pas ce qu'être une femme peut apporter à un tel emploi. Je ne suis pas partisane du fait de dire qu'une femme est différente professionnellement d'un homme. Je considère qu'on peut être dynamique ou mollasson, organisé ou bordélique, compétent ou inutile... qu'on soit un homme ou une femme.

Les désavantages à être une femme !

Ce qui se complique surtout, c'est quand vous arrivez à l'age "fatidique" des 25-30 ans où votre patron se dit "tient, mais elle va nous faire un bébé !". Oh oui le gros mot est lancé : BEBE. Ne soyons pas naïves chères lectrices (et peut-être chers lecteurs), ce qui pose problème à notre condition de femme, c'est bien la maternité. Comment mener de front une carrière dans la recherche, ce qui prend de base quelques années, tout en voulant mener une vie de famille. Nombreuses sont celles qui ont baissé les bras pour faire un enfant "tard", passé 35 ans. Nombreuses aussi sont celles qui ont tiré un trait sur leur carrière pour faire des enfants tôt, donc avant 30 ans.
Si vous avez déjà un clone génétiquement non-modifié, la difficulté est identique. La femme chercheuse est forcément une maman ultra-possessive dont le mari/compagnon ne s'occupe jamais du dit clone. Donc, devinez qui doit aller garder le bout de choux quand il est malade ? Quoi, en plus tu en veux plusieurs des enfants ?? Quoi, tu en veux 3 ? Mais c'est horrible ! Quand c'est que tu bosses ? Voilà l'opinion que j'ai souvent vue dans les laboratoires.
La super-woman carriériste de la recherche et maman ultra-pro qui fait les courses, le ménage, à manger et s'occupe de bébé n'est pas encore née. Je pense que là est le plus grand tabou et surtout la plus grande hypocrisie à notre époque, tout milieu confondu. Une femme chercheur devrait toujours faire passer sa carrière en premier, avant sa vie personnelle, ceci pour le respect de ses collègues. Mais il est à l'inverse normal dans notre monde que ce soit la femme qui s'occupe des enfants, et anormal si un homme prend un congès de paternité (si si, ça fait beaucoup jaser !!). Nous ne sommes pas encore dans un monde où on peut trouver un juste milieu...

Conclusion :

Je dirais surtout que le problème dans le recherche est qu'il est normal de ne pas compter ses heures (oups, qui a dit heures sup'). J'aime ce milieu (je suis jeune et pas encore blasée), mais les sacrifices pour une femme sont souvent plus importants que ceux d'un homme.

Dur la recherche !

Une semaine de pré-vacances d'août !

Evelyne Duvernois — Tue, 05 Aug 2008 09:46:00 +0200

J'ai décidé aujourd'hui d'inaugurer une nouvelle catégorie de mon blog, je cite "La vie du bioinformaticien". Oui je sais, je prends souvent des titres qui font peur !
Bon alors, qu'est-ce que je vais bien pouvoir raconter dedans ? En fait, c'est simple. Je vais raconter un peu ma vie de tous les jours. Vu que les journées de travail se suivent mais ne se ressemble pas, j'ai décidé de vous raconter mes journées, une fois vécue (donc le lendemain) pour vous faire partager un peu mon quotidien.

On va commencer aujourd'hui avec hier (si, si, relisez la phrase doucement, ça veut dire quelque chose.). Bref, voilà comment commence ma semaine à une semaine des vacances. Ce n'est pas forcément la semaine la plus représentative, mais c'est souvent la plus remplie de l'année...

JOUR 1 : lundi, c'est parti...

Et voilà, la semaine pré-vacances d'août commence. Ce n'est pas ma semaine favorite, on attend qu'une seule chose : le vendredi pour enfin partir en vacances (pour mon cas, mardi soir de la semaine prochaine mais passons...). Voyons un peu ce qui s'est passé hier :

7h30
Mon chéri vient me réveiller gentiment, en douceur. Il sait que sinon, je boude et je ne me lève pas. Il me demande tout aussi gentiment "chocolat ou café ?" et je lui réponds d'un ton endormi "cafééééééééééééééé". Il sort de la chambre pour me préparer le dit-café (oui oui, j'ai un super chéri !).

7h40
"Le café est prêtttttttttt". Bon bref faut que je me lève. Je pose un pied, puis l'autre et youpla je suis debout. Je vais dans le salon et prend mon petit déjeuné. Au menu café donc, et céréales, y'a plus de pain, faut faire les courses (ça commence bien les semaines comme ça).

8h03
Mon chéri s'en va travailler. Pour ma part, je saute sous la douche et dans mes habits de lumière.

8h21
Je suis au bas de la rue et attend mon bus. Pour une fois que j'arrive à attraper mon bus à l'heure !

8h40
Je suis assise à mon bureau prête à travailler. On passe en revue les flux rss du matin : on lit la presse, les blogs de regionsjob en urgence (je suis quand même au boulot...) et surtout je lis mes mails. Bon 6 spams, 1 mail informatique disant "le réseau est planté sur tel serveur"... inintéressant pour moi !

9h02
Mon chef est rentré de vacances et vient discuter un petit moment. "Comment ça va ? C'était dur sans moi ?" et patati et patata.

9h13
J'ouvre le rapport de stage de mon étudiant. Aller hop, au boulot réellement ! Je corrige, j'annote, je commente... Ça prend du temps tout ça. Je mets tout sur clef usb et rends à César ce qui va à César (bref je donne à mon étudiant une première version corrigée de son rapport de stage). Il va corriger par rapport à ce que je lui ai indiqué, et je recorrigerai, et ainsi de suite jusqu'à ce que tout soit ok !

10h42
Oulala, déjà ! Bon, j'ouvre vite mon rapport d'implémentation, regarde où j'en étais. Ah oui, il faut que je me fasse de la biblio aujourd'hui sur mes enzymes. Aller hop c'est parti sur mes désaturases, mes lipoxygénases et j'en passe. Je compare, annote, lis, rédige la fin de la matinée.

11h48
"Evy, manger ?"... Oui le "Tu viens manger ?" c'est trop long à dire. Et nous voilà parti, on n'oublie pas ceux qui sont dans les bureaux "excentrés" et nous voilà parti pour la cantine. Au menu pour moi, jambon cru avec concombre, compote et fromage blanc. Puis petit café serré pour finir le repas.

12h43
On rentre au bureau. Je réouvre mon ordinateur, fais un check-up de mes mails et flux rss, et recommence à faire ma biblio. Ben oui, c'est jamais fini les choses comme ça. J'en suis à 2 articles lus, et j'ai comme toujours des incohérences. Aller hop, une petite recherche sur PubMed pour trouver les papiers complémentaires.

13h54
Je vais me faire un petit thé. Alors aujourd'hui, c'est "Thé des Ceylan" (c'est marqué sur la boîte), ça change de mon thé vert à la menthe, sans sucre évidemment. Dans le bureau, fenêtre ouverte et ventilateur, il fait environ 30° (je le sais, on a un thermomètre !!!). Au moins la salle café est climatisée elle ! Je retourne à ma biblio et fais un peu de rangement. "J'ai besoin des oméga 6 et 3, c'est quoi ce bordel !!". Ben voilà, il faut que je range mon classeur, sinon je m'y retrouve pas. Je vérifie que mes enzymes sont correctement rangées et attaque l'article 3 de la série.

16h12
Petit mail à mon chéri "Alors pour jeudi soir c'est ok ?". Bon on continue sur la pause "psychologique". Je pars me faire mon 2ème thé de la journée "Si si, mon thé à moi infuse à 70° et pas à 100° ! Sinon il perd de ses qualités." Oui, je suis une pro en matière de thé et j'apprends plein de chose à mes collègues ( ). Bon il me reste combien de vacances ? Je pose 2 jours en septembre pour un mariage, le 2 novembre, y'a un trop gros trou et Noël. Bon, ça c'est fait. Au compteur, il me reste encore 7,5 jours de rtt... Mais je vais poser ça où ???

17h29
Je prépare ma réunion avec mon chef demain. Rentrant de vacances, il souhaite savoir ce qu'on a fait sans lui, moi et mon étudiant. L'étudiant, il prépare son travail de son côté, et moi j'ai plein de choses dont il faut que je discute avec mon chef. Je suis la pro de l'organisation alors je rassemble les 25 post-it collés sur mon étagère et fais un post-it "résumé". Au total, 8 points recensés !

18h12
Ma collègue nous fait de bisous de bonnes vacances. Elle s'en va et on se revoit en septembre. Bonnes vacances à toi. Je discute un peu avec un collègue sur "moi ma vie en thèse" (il est en pleine rédaction !).

19h00
Piouf, j'ai eu mon bus pile poil. Je peux enfin rentrer à la maison. J'y arrive 20 minutes plus tard.

20h00
Je fais à manger. Au menu de ce soir, une tranche de gigot d'agneau avec tomate piment et oignon, avec un peu de riz. Dessert : glace avec quelques petites framboises. Une fois fini de manger, on se repose devant la télé. On regarde FBI mais on les a déjà vu. On supporte le premier épisode, mais pas le 2ème. Je pars me coucher avec mon livre et je bouquine jusqu'à éteindre la lumière... Bonne nuit les petits !

Voilà une première journée dans ma vie. Ça vous a plu ?

Devenir bioinformaticien

Evelyne Duvernois — Mon, 04 Aug 2008 13:00:00 +0200

Devenir Bioinformaticien en France n'est pas chose évidente. Les formations sont récentes et pas toutes bien documentées. Je pense donc qu'un petit medlay des formations s'imposent.

Si votre envie est présente, voilà un petit tour d'horizon des diverses formations que j'ai pu recenser pour étudier la bioinformatique.
Ce recensement ne se veut malheureusement pas exhaustif, et une bonne recherche par soi-même est indispensable. Si j'ai oublié des formations, vous pouvez m'en faire part via les commentaires et je me ferais un plaisir de corriger les oublis .

Ce classement va se faire en 3 parties :

les formations menant à un bac+2 ou bac+3
celles menant à un bac+5 minimum par université (les DESS et DEA seront traités de manière identique, les thèses n'étant pas abordées ici)
les écoles d'ingénieurs

Je ne vous cite ici que les formations. Pour de plus amples informations, merci de vous référer aux liens internet.

Les formations menant à des DUT ou Licences

IUT Clermont-Ferrand 1

Sur le site d'Aurillac, on trouve un IUT Génie Biologie pouvant mener à l'obtention d'un DUT Génie Biologique Option BioInformatique. Le site internet indique aussi la possibilité de faire une licence professionnelle bioinformatique, mais je n'ai pas assez d'infos pour vous en parler.

Les formations menant à des Masters 2

MARSEILLE

Evidement, je vais vous parler ici de la propre formation que j'ai suivie. Elle s'intitule "Master Bioinformatique, Biochimie Structurale et Génomique" et permet de se spécialiser en 2ème année en Bioinformatique, Génomique ou Biologie Structurale. Des mentions professionnelles et Recherche sont proposées. Le site est Luminy (Aix-Marseille II) mais l'inscription est possible sur Aix-Marseille I (St Charles).

ROUEN

L'UMR de Rouen propose un Master Sciences Technologies Santé - Mention Biologie Santé BioInforMatique qui peut se faire en Professionnel ou Recherche

LILLE 1

L'UFR de Lille 1 propose un Master Science et Technologie mention Informatique Spécialité Bioinformatique

ORSAY

L'université Paris-Sud 11 propose dès la licence une formations BioInformatique et BioStatistique BIBS.

PARIS 7

L'université de Paris-Diderot 7 propose comme Orsay une formation dès la licence en Biologie Informatique sous la dénomination MASTER "Sciences, Santé et Applications" Mention BIOlogie-INFOrmatique Bioinformatique

TOULOUSE

Je pense savoir que l'Université Paul Sabatier de Toulouse propose un DESS de Bioinformatique mais je n'ai pas réussi à retrouver le lien internet vers les plaquettes de la formations.

BORDEAUX 2

L'Université Victor Segalen de Bordeaux 2 propose un Master Domaine Sciences, Technologies, Santé Mention Biologie et santé Spécialité Bio-informatique.

STRASBOURG

L'Université Louis Pasteur de Strasbourg propose un Master Recherche ou Professionnel Mention Vie et Santé spécialité "Génomique Structurale et Bioinformatique" (Merci à Valentine qui m'a fournit cette information)

Les écoles d'ingénieurs

LYON

Je crois savoir que l'INSA de Lyon propose une filière Bioinformatique et Modélisation mais je n'arrive pas au moment de l'écriture du billet à accéder au site internet, leur serveur présentant quelques petits soucis.

CERGY et l'EISTI

L'EISTI Ecole Internationale des Sciences du Traitement de l'Information propose un master spécialisé en bioinformatique.

CERGY et l'EBI

L'EBI Ecole de Biologie Industrielle propose un Masters of Business Engineering mention Informatique Appliquée aux Sciences de la Vie.

RENNES

L'INSA de Rennes propose un cursus Traitement des Données et Modélisation Mathématique qui donne accès en 4ème année de choisir une option bioinformatique.

MARSEILLE

L'ESIL Ecole Supérieur d'Ingénieurs de Luminy propose d'obtenir un master bioinformatique. Il faut signaler ici que le master professionnel que j'ai suivi à Marseille dépend de l'ESIL. Les formations sont donc plus ou moins entre-mêlées, même si les élèves ne se croisent pas. Les cours sont souvent dans les mêmes locaux et les professeurs sont souvent identiques.

Je pense avoir fait un bon petit tour des formations possibles en France. Il en existe sûrement d'autres que je rajouterai dès que j'en aurais connaissance.
Comme vous pouvez le remarquer, les formations sont nombreuses. Il faut bien savoir ce que l'on souhaite faire pour prendre les meilleurs options possibles. Les facultés de biologie offrent de plus en plus des modules de bioinformatique dès les licences à leurs étudiants pour permettre d'appréhender cette nouvelle discipline. Les formations se multiplient mais sans doute ne se valent-elles pas toutes. A vous de faire votre choix et si possible, le bon...

Le latin et la biologie / bioinformatique

Evelyne Duvernois — Thu, 24 Jul 2008 17:49:00 +0200

En biologie comme en médecine, nous utilisons des mots latins pour exprimer notre pensée. Le latin, ça fait pro, ça fait bien mais surtout quand tout le monde comprend ce que l'on dit.
Je vous propose donc un petit medlay de définitions latines couramment utilisé en biologie et en bioinformatique. J'espère que ceci vous permettra de mieux comprendre ma pensée...

La biologie moderne est une science récente mais qui utilise pourtant des termes latins.

Nous pouvons compter parmi ces termes latins tous les noms scientifiques des organismes. En effet, les organismes portent majoritairement le nom que les naturalistes leur ont donné au moment de leur découverte. Il s'avère que la plupart des organismes ont été découverts alors que le latin était élégamment pratiqué par la communauté scientifique. L'habitude est restée...
Je vous fais grâce ici des exemples compliqués qui ne vous diront sans doute rien. Mais je vous le jure, on s'habitue à appeler le riz, celui que vous manger, Oryza sativa. Je trouve ça très joli. La levure ? Saccharomyces cerevisiae. Un que vous connaissez... si si si... Homo sapiens, l'homme ! Ou encore le poulet, Gallus gallus...

Déjà que nous avons la fâcheuse tendance à parler mi-français mi-anglais...

Quand le latin s'en mêle, voilà quelques exemple de ce que cela peut donner :

In vivo et in vitro

Ces deux termes sont couramment utilisés lors de manipulation, c'est-à-dire d'expériences. On dit qu'une expérience est faite in vivo pour montrer que nous travaillons "dans le vivant" donc à l'intérieur de ou sur l'organisme que l'on étudie. Au contraire, ex vivo ou plus couramment in vitro indique que le travail se faire en dehors du vivant mais "dans le verre" donc dans un milieu artificiel.

In planta

Ce terme est couramment utilisé dans les laboratoires végétalistes. Sa signification précise le in vivo puisqu'il signifie "dans la plante".

In situ

Ce terme est utilisé pour indiquer qu'on observe un phénomène "sur place", sans modification, c'est-à-dire dans son milieu d'origine. A la différence de in vivo où l'on étudie un organisme souvent mort, le travail in situ oblige de garder l'intégrité du système étudié, et donc de travailler sur un organisme vivant. Cette définition fait souvent le lien entre un travail in vivo et un travail in vitro.

In utero

On travaille ici "dans l'uterus" en gestation. On étudie ici un fœtus ou un embryon (l'embryon étant le stade précédent l'embryon dans le développement) directement dans l'utérus de la femelle en gestation. Cette manière de travailler est utilisée souvent en biologie du développement pour comprendre, par exemple, comment se déroule une malformation au cours du développement, ou comprendre les phénomènes entrant en jeu dans une mauvaise gestation.

In silico

En bioinformatique, nous utilisons d'autres termes. En effet, ne travaillant pas sur du matériel vivant mais avec un ordinateur, nous disons que nous générons des données in silico c'est-à-dire "dans le silicium". Cela indique que nous travaillons grâce à des simulations informatiques.

De novo

Ce terme indique la nouveauté d'un élément. Il est un peu compliqué d'indiquer une définition fiable à ce terme car il est très utilisé et de manière différente selon les disciplines. En bioinformatique, il indique par exemple une nouvelle structure 3D d'une protéine qu'on a identifié de manière informatique. Je vous propose de vous référer à un pdf de Pharmaterm rédigé par Diane Bouilhac pour de plus amples explications.

Locus

Le locus d'un gène est l'endroit où il est placé sur le génome. En effet, tous les ATGC et donc les acides aminés sont comptés dans un génome, sur l'ADN des organismes séquencés. Ainsi, on peut indiquer précisément la position d'un gène au sein de tout une génome.

Consensus

Consensus est un terme courant dans la langue française. En alignement de séquences, on parle de séquences consensus pour désigner la séquence que l'on retrouve dans les deux séquences que l'on aligne.

Per se

"Per se" est un terme que l'on retrouve parfois dans les publications qui signifie par traduction directe "par soi". Ce terme n'est pas uniquement utilisé dans le milieu de la Recherche et on retrouve parfois ce terme dans les textes de loi.

Je me ferai un plaisir de compléter cette liste si d'autres termes me viennent.
Bonne lecture et bon latin !

EDIT :
Ajout de in situ, in utero

EDIT 2 : Ajout de in planta

EDIT 3 : Ajout de per se

Apport de la bioinformatique dans la vie de tous les jours

Evelyne Duvernois — Tue, 22 Jul 2008 09:42:00 +0200

Et oui, la bioinformatique c'est un nom compliqué. On ne sait pas bien à quoi cela sert, on ne sait non plus ce que font ces fameux bioinformaticiens. Mais la question qui brûle les lèvres à tout le monde, c'est surtout : qu'est-ce que ça nous apporte à nous, pauvres mortels ?

La question est difficile et la réponse encore plus. La bioinformatique n'est pas un métier où les applications sont directes, visibles, applicables. Le travail du bioinformaticien est le plus souvent une aide pour appréhender un phénomène P.

Tentative d'explication par l'exemple tout de même. Suivez le guide !

En quoi la bioinformatique est utile à la société ? C'est une bonne question, merci de l'avoir poser !

Le bioinformaticien développe des médicaments ? Pas vraiment !
Le bioinformaticien crée de nouveaux logiciels pour le public ? Non plus !
Mais alors, que fait-il véritablement pour notre société ?

Il est relativement difficile à répondre à la question "que fait le bioinformaticien pour nous ?". Le travail du bioinformaticien est en relation avec le monde de la biologie dans son ensemble, sans pour autant être "visible" de l'extérieur. Il est clair que son action influe sur les percées dans certains domaines mais il faut avouer que pour le commun des mortels, vu de l'extérieur, son travail est plutôt abstrait voire illusoire voire inutile (?). Je vais tout de même tenter une présentation des bienfaits apportés par la bioinformatique au monde de la biologie, et donc ayant un intérêt pour tous.
Comment donc répondre à cette question le mieux possible ? Je vais tenter d'aborder des petits exemples dans lesquels l'action d'un bioinformaticien est requise. Peut-être ces exemples vous aideront-ils à mieux percer à jour l'intérêt d'une telle valeur ajoutée pour un laboratoire.

Je pense que vous avez tous toucher à un ordinateur dans votre vie (sinon vous ne seriez pas en train de me lire) et que vous avez tous parcouru des listings de milliers de lignes en quête d'une information X ou Y, que vous avez sans doute dû un jour copier coller des dizaines de fichiers, ou que vous avez déjà perdu votre dossier contenant le rapport hyper important de la réunion du lendemain. C'est "petites" choses sont tout autant présentes en biologie, à ceci près que le volume de données est bien souvent énorme, qu'une traçabilité est nécessaire dans toute expérience et que des tests statistiques doivent valider les résultats. Une répétition des tâches est souvent nécessaires pour obtenir un résultat. La bioinformatique peut aider un biologiste en créant des scripts qui feront ces tâches répétitives sans qu'aucune erreur de copier-coller ne sera produite : pipeline d'alignement de séquences, remplissage automatique de bases de données à partir de fichier ou formulaires (sauvegarde + rangement). Bref, tout ceci augmente de manière considérable la productivité d'un laboratoire puisque des tâches répétitives sans aucun intérêt scientifique peuvent être faites plus vite et mieux via des programmes informatiques.

De plus, et comme précisé précédemment, la biologie nécessite des contrôles soigneux, des vérifications, des contre-expertises, ce qui nécessitent l'utilisation de tests statistiques. Ainsi, les chercheurs peuvent faire appel à des biostatisticiens pour gérer les problèmes mathématiques et assurer un contrôle qualité du produit. Le biostatisticien peut étudier une population, faire des hypothèses d'évolution... et se servir des logiciels spécifiques de manière plus fine que ne le ferait un biologiste avec peu de connaissances en mathématiques probabilistes. Il pourra aussi développer informatiquement des scripts permettant la réalisation automatique d'une chaîne de contrôles statistiques pour valider une expérience.

En outre, en biologie, nous avons souvent à faire face à un problème très ennuyeux : le problème technique ! Souvent, la technique actuelle nous bloque dans nos expériences. En effet, par exemple, pour représenter en 3D une molécule, celle-ci doit être cristallisée puis analysée très précisément. Or, dans de nombreux cas, la cristallisation est impossible. On fait donc appel à des bioinformaticiens qui auront pour tâche d'élaborer une comparaison avec des protéines proches pour "deviner" la structure la plus probable d'une manière statistique. C'est ce qu'on appelle faire de la prédiction de structure. Cela passe par l'étude d'homologues (protéines autres proches de manière évolutive) mais aussi par l'analyse de la séquence des acides-aminés. Ma connaissance du sujet étant faible, j'espère que vous me pardonnerez mes raccourcis.
La prédiction est un travail récurrent pour le bioinformaticien qui travaille souvent sur des données dites "putatives" c'est-à-dire non vérifiées expérimentalement. Personnellement, je crée des données de manière in silico, c'est-à-dire des données informatiques qui collent à la réalité biologique.
C'est aussi ce besoin qui permet aux bioinformaticiens de développer les logiciels de demain !

Enfin, le bioinformaticien est très utile quand il s'agit de mettre en place un partage de connaissances pour toute la communauté scientifique. En effet, la biologie n'est utile que si plusieurs équipes peuvent travailler de manière conjointe, et avoir accès à des logiciels semblables. Pour ce faire, des nombreuses connaissances sont partagées sur la toile via des banques de données publiques, qui permettent d'avoir à disposition les protéines connues pour un organisme donné, les voies métaboliques particulière d'un autre, la structure des protéines, des enzymes, des classifications qui font foi dans la communauté (ontologies GO)... Il n'y a plus de chercheurs fous dans son laboratoire, seul et protégeant ses connaissances. Le monde de la recherche est actuellement à l'ère de la collaboration. On partage et on reconnaît le travail de chacun.

Certes, l'activité réelle du bioinformaticien n'est pas forcément visible pour tout un chacun, mais elle devient vite essentielle au bon déroulement des recherches dans un laboratoire pour automatiser des tâches, vérifier la qualité des produits, développer les nouveaux logiciels et prédire des événements, et surtout partager les connaissances.

En espérant vous avoir éclairer sur mon métier... N'hésitez pas à me poser des questions !