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Une semaine de pré-vacances d'août !

Evelyne Duvernois — Tue, 05 Aug 2008 09:46:00 +0200

J'ai décidé aujourd'hui d'inaugurer une nouvelle catégorie de mon blog, je cite "La vie du bioinformaticien". Oui je sais, je prends souvent des titres qui font peur !
Bon alors, qu'est-ce que je vais bien pouvoir raconter dedans ? En fait, c'est simple. Je vais raconter un peu ma vie de tous les jours. Vu que les journées de travail se suivent mais ne se ressemble pas, j'ai décidé de vous raconter mes journées, une fois vécue (donc le lendemain) pour vous faire partager un peu mon quotidien.

On va commencer aujourd'hui avec hier (si, si, relisez la phrase doucement, ça veut dire quelque chose.). Bref, voilà comment commence ma semaine à une semaine des vacances. Ce n'est pas forcément la semaine la plus représentative, mais c'est souvent la plus remplie de l'année...

JOUR 1 : lundi, c'est parti...

Et voilà, la semaine pré-vacances d'août commence. Ce n'est pas ma semaine favorite, on attend qu'une seule chose : le vendredi pour enfin partir en vacances (pour mon cas, mardi soir de la semaine prochaine mais passons...). Voyons un peu ce qui s'est passé hier :

7h30
Mon chéri vient me réveiller gentiment, en douceur. Il sait que sinon, je boude et je ne me lève pas. Il me demande tout aussi gentiment "chocolat ou café ?" et je lui réponds d'un ton endormi "cafééééééééééééééé". Il sort de la chambre pour me préparer le dit-café (oui oui, j'ai un super chéri !).

7h40
"Le café est prêtttttttttt". Bon bref faut que je me lève. Je pose un pied, puis l'autre et youpla je suis debout. Je vais dans le salon et prend mon petit déjeuné. Au menu café donc, et céréales, y'a plus de pain, faut faire les courses (ça commence bien les semaines comme ça).

8h03
Mon chéri s'en va travailler. Pour ma part, je saute sous la douche et dans mes habits de lumière.

8h21
Je suis au bas de la rue et attend mon bus. Pour une fois que j'arrive à attraper mon bus à l'heure !

8h40
Je suis assise à mon bureau prête à travailler. On passe en revue les flux rss du matin : on lit la presse, les blogs de regionsjob en urgence (je suis quand même au boulot...) et surtout je lis mes mails. Bon 6 spams, 1 mail informatique disant "le réseau est planté sur tel serveur"... inintéressant pour moi !

9h02
Mon chef est rentré de vacances et vient discuter un petit moment. "Comment ça va ? C'était dur sans moi ?" et patati et patata.

9h13
J'ouvre le rapport de stage de mon étudiant. Aller hop, au boulot réellement ! Je corrige, j'annote, je commente... Ça prend du temps tout ça. Je mets tout sur clef usb et rends à César ce qui va à César (bref je donne à mon étudiant une première version corrigée de son rapport de stage). Il va corriger par rapport à ce que je lui ai indiqué, et je recorrigerai, et ainsi de suite jusqu'à ce que tout soit ok !

10h42
Oulala, déjà ! Bon, j'ouvre vite mon rapport d'implémentation, regarde où j'en étais. Ah oui, il faut que je me fasse de la biblio aujourd'hui sur mes enzymes. Aller hop c'est parti sur mes désaturases, mes lipoxygénases et j'en passe. Je compare, annote, lis, rédige la fin de la matinée.

11h48
"Evy, manger ?"... Oui le "Tu viens manger ?" c'est trop long à dire. Et nous voilà parti, on n'oublie pas ceux qui sont dans les bureaux "excentrés" et nous voilà parti pour la cantine. Au menu pour moi, jambon cru avec concombre, compote et fromage blanc. Puis petit café serré pour finir le repas.

12h43
On rentre au bureau. Je réouvre mon ordinateur, fais un check-up de mes mails et flux rss, et recommence à faire ma biblio. Ben oui, c'est jamais fini les choses comme ça. J'en suis à 2 articles lus, et j'ai comme toujours des incohérences. Aller hop, une petite recherche sur PubMed pour trouver les papiers complémentaires.

13h54
Je vais me faire un petit thé. Alors aujourd'hui, c'est "Thé des Ceylan" (c'est marqué sur la boîte), ça change de mon thé vert à la menthe, sans sucre évidemment. Dans le bureau, fenêtre ouverte et ventilateur, il fait environ 30° (je le sais, on a un thermomètre !!!). Au moins la salle café est climatisée elle ! Je retourne à ma biblio et fais un peu de rangement. "J'ai besoin des oméga 6 et 3, c'est quoi ce bordel !!". Ben voilà, il faut que je range mon classeur, sinon je m'y retrouve pas. Je vérifie que mes enzymes sont correctement rangées et attaque l'article 3 de la série.

16h12
Petit mail à mon chéri "Alors pour jeudi soir c'est ok ?". Bon on continue sur la pause "psychologique". Je pars me faire mon 2ème thé de la journée "Si si, mon thé à moi infuse à 70° et pas à 100° ! Sinon il perd de ses qualités." Oui, je suis une pro en matière de thé et j'apprends plein de chose à mes collègues ( ). Bon il me reste combien de vacances ? Je pose 2 jours en septembre pour un mariage, le 2 novembre, y'a un trop gros trou et Noël. Bon, ça c'est fait. Au compteur, il me reste encore 7,5 jours de rtt... Mais je vais poser ça où ???

17h29
Je prépare ma réunion avec mon chef demain. Rentrant de vacances, il souhaite savoir ce qu'on a fait sans lui, moi et mon étudiant. L'étudiant, il prépare son travail de son côté, et moi j'ai plein de choses dont il faut que je discute avec mon chef. Je suis la pro de l'organisation alors je rassemble les 25 post-it collés sur mon étagère et fais un post-it "résumé". Au total, 8 points recensés !

18h12
Ma collègue nous fait de bisous de bonnes vacances. Elle s'en va et on se revoit en septembre. Bonnes vacances à toi. Je discute un peu avec un collègue sur "moi ma vie en thèse" (il est en pleine rédaction !).

19h00
Piouf, j'ai eu mon bus pile poil. Je peux enfin rentrer à la maison. J'y arrive 20 minutes plus tard.

20h00
Je fais à manger. Au menu de ce soir, une tranche de gigot d'agneau avec tomate piment et oignon, avec un peu de riz. Dessert : glace avec quelques petites framboises. Une fois fini de manger, on se repose devant la télé. On regarde FBI mais on les a déjà vu. On supporte le premier épisode, mais pas le 2ème. Je pars me coucher avec mon livre et je bouquine jusqu'à éteindre la lumière... Bonne nuit les petits !

Voilà une première journée dans ma vie. Ça vous a plu ?

Le débat du mois : les différentes formes de CV

Evelyne Duvernois — Wed, 02 Apr 2008 11:53:00 +0200

Le débat du mois d'avril est arrivé et avec lui tout plein de questions sur le CV... Ah la la, un CV, élément indispensable à toute bonne candidature...
Mais comme le dit si bien notre modérateur: que doit-on ajouter à un CV et de quelle manière ? En voilà de bonnes questions. Je vais tenter comme à chaque fois de vous donner des éléments que je considère comme important, et vous invite à modérer mes propos via les commentaires...

Aller hop c'est parti, il faut faire son CV... Mais c'est quoi un CV déjà ? A quoi ça sert ? et qu'est-ce que je mets dedans ?
Tout un tas de questions que tout le monde s'est déjà posé au moins une fois. Un CV, ça doit faire mouche, ça doit permettre au recruteur de comprendre un parcours scolaire et professionnel, ça doit l'aider à cerner le candidat... au risque de finir là :

Je vais donc passer ici en revu ce que je retiens de la mise en forme d'un CV, ainsi que des éléments "obligatoires" à inscrire... mais commençons par un peu d'histoire...

Un petit brin d'histoire

D'après ce que j'ai trouvé sur le sujet, le terme "curriculum vitae" vient du latin "currere", courir et "vita", la vie. Sa signification est donc "cours de la vie", ou plutôt "parcours de vie" ou "chemin de vie", comme le précise déjà Christian ici.
Son origine remonterait jusqu'à Cicéron mais l'emploi de ce terme en français date plutôt du XIXème siècle pour décrire son parcours professionnel et pointer sur ses qualifications.

L'amorce

Je dirais qu'un bon CV commence par une amorce, quelque chose qui va capter l'attention du recruteur. Mettre une accroche avec l'emploi que l'on désire va permettre au recruteur de cibler vos attentes en une courte ligne, et de voir tout de suite si le poste proposé va "coller" ou non. Cela permet aussi de confirmer que votre projet professionnel est au point, que vous savez ce que vous voulez, que vous êtes décidé, et donc, que vous êtes potentiellement apte à quitter un ancien emploi si celui qu'on vous propose est mieux, et à vous y investir totalement.
Une bonne accroche met le recruteur en confiance !

Les éléments indispensables

Un bon CV doit contenir des éléments obligatoires, sans quoi votre CV si joli soit-il, finira à la poubelle.

L'état civile : oui je sais c'est idiot de le préciser surtout si vous considérez que sans, le recruteur aura quelques problèmes à vous joindre pour vous fixer un rendez-vous...
Votre parcours scolaires : nul n'est besoin de remonter à la maternelle, les principaux dipômes/concours comptent ici. Toutefois, peut-être est-il intéressant de détailler un parcours non conventionnel si cela peut avoir une importance dans le travail auquel on postule. Pour ma part, j'ai un Master mais je rajoute quand même mes 2 années de Classes Préparatoires pour préciser mon côté multi-discipline, confirmé par mon emploi en bioinformatique.
Vos expériences professionnelles : Il faut relater ici votre parcours au sein des diverses entreprises (emploi CDD/CDI mais aussi stage) dans lesquels vous avez pu travailler. Ce paragraphe doit être adapté au profil recherché. Attention, je ne dis pas qu'il faille mentir ouvertement, ou par omission, mais peut-être qu'un emploi saisonnier en tant que barman dans un boîte de nuit n'est pas utile avec 15 ans d'expérience en management de projet...
Vos compétences : C'est le paragraphe à mettre en avant pour des jeunes diplômés qui ont peu d'expérience professionnelle. Leurs qualifications obtenues lors de leurs études peuvent être mis en avant pour confirmer une capacité. Pour ma part, j'indique mes compétences pratiques dans le domaine bioinformatique et génomique et de l'informatique mais aussi mes compétences relationnelles.
Les langues étrangères : le fameux "parlé, lu, écrit" intéresse de moins en moins les recruteurs, en particulier dans les domaines scientifiques. Il préfère voir une note aux fameux concours type TOEIC ou TOEFL. N'hésitez pas à préciser une langue autre que le français comme langue maternelle si c'est le cas (je parle pour un poste en France).
Un complément d'informations : Vous pouvez préciser ici que vous possédez le permis B, ce qui peut avoir une influence si vous postulez, par exemple, à un emploi de commercial.

Les autres éléments possibles

D'autres éléments sont possibles comme par exemple, vos activités extra-professionnelles. J'avoue qu'ici, je préfère mettre des éléments vraiment intéressants pour le recruteur, et je ne considère pas qu'il va être intéressé par mes habituels pique-niques au grand air des samedis midis... Toutefois, et suivant les emplois, peut-être est-il intéressant de mettre en avant une activité sportive de groupe, pour signifier sa "sociabilité". Il n'y a pas de véritables règles, mais il faut voir si ce que l'on ajoute à un CV est pertinent ou non. Si ça ne l'ai pas, retirez-le, sinon le recruteur aura l'impression que le CV est creux et que l'on cherche à "remplir les trous".

De même, il est peut-être important d'indiquer que vous avez des enfants en bas âges, pour expliquer les absences vers le 3 septembre de chaque année (vive la rentrée...) ou pourquoi quand votre nounou vous lâche sans prévenir, vous ne pouvez pas venir travailler. Il en va de même avec votre situation personnelle, si vous êtes marié ou non...

Bref, à vous de juger...

L'ordre de tout ça....

La logique et l'habitude veut que l'état civil soit en haut à gauche du CV. Quoi ? Je dois recommencer le mien ?
Disons que l'état civil doit être la première chose que doit voir un recruteur, ne serait-ce pour savoir où vous habitez, et si vous devez déménager pour le poste. Qu'il soit en haut, ou sur la côté, à gauche ou à droite, l'important est qu'il soit visible !
Pour le reste des informations, si les expériences professionnelles doivent être avant les compétences mais après le parcours scolaire, tout dépend de votre CV. Si vous trouvez que les éléments importants sont les compétences, mettez-le en premier. Souvent les recruteurs regardent le parcours professionnel. Je prend encore l'exemple des jeunes diplômés. Ce paragraphe va paraître bien mince, surtout s'il est en premier.
Pour ma part, j'indique mon parcours scolaires en dernier, souhaitant privilégier mes expériences professionnels, et mon parcours particulier qui m'a permis d'être opérationnelle dans de nombreux domaines.

La forme

Maintenant que le fond est vu, on va passer à la forme.
Pour ma part, je souhaite privilégié une forme dynamique et profesionnelle, avec un peu de couleurs, qui tranche avec les CV ternes qu'on a peu envi de regarder. Je souhaite que mon CV attire l'oeil, mais pas non plus qu'il ressemble à un sapin de noël. J'ai donc choisi une unique couleur tranchant avec mes indications sur fond blanc, pour indiquer mon état civil, et mettre un peu de gaité dans mon CV.

Pour mettre en avant quelques informations, j'ai choisi de mettre en gras les éléments à valoriser pour un type d'emploi. Ainsi, ce ne sont pas les années de mes diplômes qui sont mis en avant, mais plutôt le type de diplôme, idem pour mes compétences et expériences professionnelles. Je cherche toujours à savoir quels seront les éléments que le recruteur souhaitera voir en premier, et je lui facilite le travail en les lui mettant en en gras.

Photo, pas photo ? Nom ou pas nom ?

Ah lala, question existentielle du CV, photo ou pas photo ? Mon prof de RH nous disait "à moins que vous soyez mannequin, je ne vois pas l'intérêt"... et je suis bien d'accord. Mais pourquoi alors ai-je mis ma photo sur mon CV ? Sans doute pas habitude, et sans doute aussi par la multiplication d'annonce précisant "CV avec photo" contre aucune disant "photo non obligatoire".
La question est identique à propos des CV anonymes. Je serais tout à fait d'accord pour retirer mon nom des CV si ceux-ci n'étaient pas demander, ou si on ne demandait pas de référents. Comment un recruteur pourrait-il demander à un de mes référent des éléments sur moi sans lui préciser mon nom ?

Pourquoi autant se compliquer la vie ?

Je pense que les recruteurs sont des gens très occupés, qui n'ont pas forcément le temps de lire des dizaines de CV par jours. Un CV un peu plus accrocheur par son accroche (c'est le cas de le dire...), par sa forme, va plus retenir l'attention qu'un autre. Dans le monde dans lequel nous vivons, avec les problèmes de chômage (ben voui), un monde de "toujours faire plus", de "toujours faire mieux", il est essentiel d'apporter ce petit quelque chose qui va faire la différence, et vous fera décrocher le job de vos rêves !

En espérant avoir pû aider ou conseiller certains, ou tout simplement informer, je reste à votre disposition si vous souhaitez modifier un élément !

Le détail qui tue !

Un CV est généralement sensé tenir en une page en France, mais il existe des exceptions. Toutefois, et en particulier en science où l'on a de nombreuses publications au fil des années, cela ne rentre plus du tout en une seule page.
Ainsi, le candidat peut de plus en plus préciser un site internet avec un "CV détaillé" pour compléter celui envoyé au recruteur. Cela se fait de plus en plus et est souvent sensé ! Votre CV doit être rapide à lire mais si le recruteur souhaite des précisions sur un poste, il peut directement se rendre sur votre site internet spécialement dédié à cela.

Est-on handicapé du coeur ?

Evelyne Duvernois — Thu, 13 Mar 2008 08:02:00 +0100

Dans la lignée ouverte par Véronique, la rédaction, et bien d'autres encore, je vais donner ici ma contribution au thème sur le handicap au travail.

Intégration difficile, problème logistique ? Quelle est notre vision du handicap au travail ? Voilà de quoi je me propose de vous parler...

L'handi-tolérance

Le handicap au travail est un thème très intéressant. Sommes-nous réellement handi-tolérant. Voici un petit test dont le lien a déjà été signalé par Sylve lors de son billet Handicap... T'es pas cap ?! pour tester votre handi-tolérance. Voici mes propres résultats :

Votre note : 18.5/20

Véritable intégrateur du handicap, vous êtes aujourd'hui de ceux qui contribuent à un meilleur accueil des personnes handicapées, nous comptons sur vous ! Vous vous engagez et vous refusez l'intolérance. Pour vous, le fait de travailler ensemble n'a plus de secret. Attention n'en faites pas trop, une personne handicapée est une personne comme une autre : elle n'a pas tant besoin d'être assistée que d'être accueillie comme n'importe quel autre salarié.

Rejet du handicap ?

Je pense qu'il est difficile de parler d'un handicap quand on n'en est pas soi-même atteint. Je n'ose pas essayer de comprendre ce que les handicapés ressentent envers un rejet. Toutefois, je connais et côtoie des personnes handicapées et je vois certaines de leur difficulté, en particulier au travail. Que l'on soit valide ou non, cette question de l'intégration des handicapés dans le monde du travail nous préoccupe. Est-on bien sûr de faire le maximum pour leur rendre la vie plus "facile" ? Voulons-nous réellement prendre le taureau par les cornes pour rendre les choses meilleures ?

Je pense ici que cela diffère selon les gens et selon les milieux professionnels. Je suis, pour ma part, heureuse de constater que partout où j'ai travaillé, les handicapés sont plutôt bien étaient intégrés. Les mentalités évoluent-elles ou le monde scientifique est-il plus propice à l'accueil des handicapés ? Mais pourquoi emploie-t-on des handicapés ? Simplement pour faire bien ou pour donner une belle image à l'entreprise ? J'espère sincèrement que non, et j'espère tout autant que ces embauches révèlent une véritable volonté sociale portée sur l'individu employé, et non sur les possibles retombées économiques pour l'entreprise.

En conclusion

Je dirais, pour finir ce billet, que les compétences pour moi priment sur la santé. Pourquoi ne pas donner sa chance à quelqu'un qui est apte, qui est capable, et qui saura parfaitement s'intégrer dans une équipe, dans des méthodes de travail et dans une directive commerciale quelconque ? Pensons un peu que nous aussi, un jour, un accident de la vie pourra nous prendre notre mobilité, ou un de nos sens, pour ne parler que du physique. Devrons-nous alors arrêter de travailler et arrêter toute vie sociale ? Ou préfèrerons-nous que des gens se soient battus pour les handicapés, pour leur intégration... ?

Je pense que la meilleure intégration sera quand on ne se posera plus la question, que tout ira de soit, et que des semaines du handicap au travail, et des billets en rapport sur des blogs se seront plus d'actualité, car tout handicapé sera intégré de manière normale en entreprise, et qu'on ne les mettra plus dans une "classe", dans une "case" qui me parraît à moi, bien restrictive.... Un handicapé, c'est une personne avant tout...
Pour bientôt ? J'espère !

De quoi pourrait-on parler ?

Evelyne Duvernois — Thu, 21 Feb 2008 14:21:00 +0100

En voilà une bonne question ? Mais de quoi pourrais-je bien vous parler ?
Pour un soucis de rapprochement avec mes lecteurs, je laisse ici un espace libre dans lequel vous pouvez me demander de vous parler d'un sujet... Pas de limitations particulières pour ce sujet, du moment qu'il touche un temps soit peu au monde :

de la bioinformatique naturellement... mais aussi
de la biologie
de l'informatique pourquoi pas
de la recherche
ou de la science en général...

Donc, à vos commentaires...
Chaque semaine, je tenterai de répondre à un sujet au minimum....

Laisser donc s'exprimer votre inventivité !

Ma vie, mon métier.... : Phylogénéticien !

Evelyne Duvernois — Mon, 11 Feb 2008 15:21:00 +0100

Pour continuer notre série "Ma vie, mon métier..." débutée ici, je vais vous parler aujourd'hui d'une des facettes que je préfère dans la bioinformatique/génomique : la phylogénie ou comment remonter le temps grâce à l'ADN...

L'ADN, mais qu'est-ce que c'est que cette bête là ???

L'ADN ou Acide DesoxyriboNucléique est une molécule contenue dans toutes les cellules des être vivants, des plantes aux animaux, en passant par les bactéries. Cette molécule a la particularité de détenir ce que nous, biologistes, appelons l'information génétique. En effet, au sein d'une même espèce, par exemple l'homme, l'ADN entre individus est quasi semblable mais possède des différences qui peuvent nous permettre d'identifier un individu plutôt qu'un autre... Seuls des vrais jumeaux ont le même ADN...
L'ADN est constitué de 4 éléments qu'on appele bases azotées : adénine A, thymine T, guanine G et cytosine C... (Il existe une autre base Uracile U mais présente dans une autre molécule appelée ARN...). Ces bases s'associent 2 à 2 (A avec T et G avec C) et forment la structure très connue de l'ADN en double hélice...
Dans les cellules, l'ADN est "transcrit" en ARN (acide RiboNucléique) selon la règle : A donne T, T donne A, C donne U et G donne C...

Les acides aminés maintenant

Je suis sûre que beaucoup d'entres vous ont déjà entendu parler de acides aminés. Ce sont de petites molécules élémentaires, qui sont la base des protéines du corps. La création des acides aminés est régi par un code immuable qu'on appelle "code génétique" et qui permet d'associer une série de 3 bases azotées de l'ARN à un acide aminé...

Le rassemblement de ces acides aminés forment une protéine.

La phylogénie dans tout ça...

La phylogénie est l'art d'étudier les séquences protéines (la succession des acides aminés pour une protéine) au sein de plusieurs espèces pour retracer l'évolution de ces espèces. En effet, il faut considérer ici que les protéines ne sont pas figées. Au cours du temps, et le long d'espèces qui sont apparus, les séquences protéiques ont été modifiées, en remplaçant un acide aminé par un autre, ou encore en supprimant (ou insérant) toute un partie de la séquence.
En étudiant les séquences, les phylogénéticiens peuvent remonter l'histoire de la séquence et donc l'histoire de l'évolution...

Les missions du phylogénéticien

La mission principale est bien évidemment de retracer l'histoire évolutive d'espèces différentes. Mais cela passe par plusieurs étapes :

Récupérer les séquences protéiques : les séquences protéiques sont trouvées soit directement sur des banques de données publiques telles que le NCBI ou UniProtKB. Toutefois, pour certains organismes, les protéines ne sont pas toutes découvertes. On se réfère alors à l'ADN que l'on va traduire en protéine.
Aligner les séquences : Les séquences seules ne suffisent pas. En effet, et du fait des insertions / délétions de parties de séquences (voir plus haut), le phylogénéticien doit aligner toutes les séquences à étudier. Cela passe par des outils automatiques tels que ClustalW mais tout alignement doit être revu à la main.
Lancement des calculs et génération des arbres : Une fois les alignements obtenus, il faut lancer des calculs sur les séquences, calculs régi par des lois de probabilité (maximum de vraisemblance, lois bayésiennes...). Ces calculs permettent d'établir ce qu'on appelle une distance entre les séquences c'est-à-dire définir quelle séquence est plus proche de quelle autre... et ainsi de suite. Une fois ces distances calculées, des logiciels permettent de représenter le résultat sous forme d'arbre...

Interprétation des arbres : Le vrai travail commence à cette étape où le phylogénéticien interprète les résultats et donc les arbres. Suivant les calculs réalisés, les arbres sont différents. Il peuvent représenter une distance évolutive (gamme de temps) ou simplement une topologie (organisation visuelle).

Pourquoi ces études sont-elles importantes ?

L'étude de la phylogénie permet de comprendre comment les protéines ont évoluées, et surtout comment les espèces ont évoluées entre elles. L'idée est souvent que l'évolution est linéaire entre individu et entre protéine. Or, l'étude de la phylogénie montre que ce n'est pas le cas. Elle montre aussi que des protéines évoluent dans une espèce plus vite que d'autres, ce qui est lié à ce qu'on appelle la pression de sélection.
La phylogénie nous permet de comprendre pourquoi certaines protéines ont été sélectionnées par la nature plutôt que d'autres, pourquoi des organismes se sont éteints, pourquoi ils ont une caractéristique physique plutôt qu'une autre.
Plus près de nous, cela nous permet aussi de combattre certaines pathologies en attaquant des protéines ciblées du pathogène (bactérie, virus, parasite...) en sachant que les protéines humaines ne seront pas touchées car différentes...

source du code génétique :
--> google sous la requête "code génétique"
--> récupération sur le site de l'Université de Sherbrooke, relatif à la biochimie des protéines