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  <title>Une ingénieur ingénieuse en bioinformatique... - Tag - thème de la semaine</title>
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  <pubDate>Thu, 20 Nov 2008 09:49:54 +0100</pubDate>
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    <title>Le thème de la semaine : une cellule biologique...</title>
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    <pubDate>Fri, 11 Apr 2008 12:37:00 +0200</pubDate>
    <dc:creator>Evelyne Duvernois</dc:creator>
        <category>Le thème de la semaine...</category>
        <category>biologie</category><category>blog-emploi</category><category>cellule</category><category>science</category><category>thème de la semaine</category>    
    <description>&lt;p&gt;&lt;img src=&quot;http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/public/Logos/LTDS.GIF&quot; alt=&quot;Le thème de la semaine&quot; style=&quot;display:block; margin:0 auto;&quot; /&gt;
&lt;br /&gt;
Comme je vous l'avais précisé il y a... et oui, plus d'un mois maintenant &lt;a href=&quot;http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/index.php/post/2008/02/22/Le-theme-de-la-semaine-%3A-Le-systeme-immunitaire#c145126&quot; hreflang=&quot;fr&quot;&gt;ici&lt;/a&gt;, je vais vous parler un peu plus profondément de la réponse immunitaire.... Non je rigole. Je crois que j'ai définitivement abandonné mon idée de vous parler de ça, vu que ce n'ai pas ma tasse de thé, mais pas du tout...
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
Je disais donc, aujourd'hui, je vais vous parler des cellules, vous savez, ces petites choses qu'on a en millions d'exemplaires... Mais à quoi cela ressemble-t-il vraiment&amp;nbsp;? Qu'est-ce qu'on y trouve&amp;nbsp;?&lt;/p&gt;    &lt;h3&gt;Un peu d'histoire pour commencer&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Replaçons-nous dans le contexte, milieu de 17ème siècle, en Angleterre. &lt;a href=&quot;http://fr.wikipedia.org/wiki/Robert_Hooke&quot; hreflang=&quot;fr&quot;&gt;Robert Hooke&lt;/a&gt; (1634-1703) est un scientifique expérimentale membre de la Royal Society de Londres depuis 1663. Ses études sont diverses et il étudie en particulier les propriétés des cristaux et de la lumière. Il est aussi inventeur (régulateur pour balancier de montres, système de télégraphie optique, moyens de voler dans les airs, baromètres à roue, hélioscope, thermomètre à alcool...). &lt;br /&gt;
Pour la biologie plus particulièrement, il fait de nombreuses observations telles que les ailes d’insectes, les puces et les poux, qu'il étudie grâce au microscope de sa fabrication. Il étudie aussi la transfusion sanguine ou encore les greffes de peau ainsi que l'anatomie des végétaux fossiles et vivants, dont il fit l'anatomie comparée.
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
C'est dans son ouvrage &lt;strong&gt;Micrographia, or Some Physiological Descriptions of Minute Bodies Made by Magnifying Glasses&lt;/strong&gt; publié en 1665 qu'il décrit pour la première fois le terme de &lt;strong&gt;&quot;cellule&quot;&lt;/strong&gt;, employé pour décrire de petites alvéoles qu'il a pu observé dans le liège. Ce terme est issu du latin &lt;em&gt;cellula&lt;/em&gt; qui désigne de petites chambres.
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;

&lt;h3&gt;Qu'est-ce qu'une cellule...&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Une cellule correspond à une &lt;strong&gt;unité structurale, fonctionnelle et reproductrice&lt;/strong&gt; d'un individu (à entendre ici au sens large). Les cellules sont le constituant d'un organisme, et sont présentes en un ou plusieurs exemplaires pour un même organisme vivant (on exclue actuellement du monde vivant les virus). Chaque cellule est une entité &lt;strong&gt;vivante&lt;/strong&gt; et est &lt;strong&gt;autonome&lt;/strong&gt; mais coordonnée avec les cellules avoisinantes.
&lt;br /&gt;
Les cellules sont regroupées en &lt;strong&gt;tissu&lt;/strong&gt; et les tissus s'organisent en &lt;strong&gt;organe&lt;/strong&gt;.
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;

&lt;h3&gt;Présentation de cellules &quot;types&quot;&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Les cellules, quelles soient animales, végétales ou bactériennes, regroupent un certain nombre de structures appelées &lt;strong&gt;organites&lt;/strong&gt; communes. Toutefois, chaque type de cellules (organisme différent, tissu différent) possède ses propres caractéristiques, caractéristiques que je ne ferais que survoler ici. &lt;br /&gt;
Une cellule &lt;strong&gt;eucaryote&lt;/strong&gt; c'est-à-dire &quot;évoluée&quot; possède au minimum&amp;nbsp;:&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;un noyau&amp;nbsp;: contient l'information génétique&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;un cytoplasme délimité par une membrane&amp;nbsp;: est le milieu intérieur de la cellule, qui permet une conservation des constantes de pH, de concentrations...&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;un réticulum endoplasmique et un appareil de Golgi&amp;nbsp;: qui sert au transport de molécules&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;des mitochondries&amp;nbsp;: qui produit l'énergie&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;des vésicules&amp;nbsp;: qui stocke des molécules&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;p&gt;&lt;img src=&quot;http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/public/Biologie/celluleEuc_reduite.GIF&quot; alt=&quot;cellule eucaryote&quot; style=&quot;display:block; margin:0 auto;&quot; /&gt;
&lt;br /&gt;
C'est le cas des cellules animales. Les cellules végétales sont plus grosses (200µm contre 50 pour l'animale) et possèdent un autre type d'organites appelé &lt;strong&gt;chloroplastes&lt;/strong&gt; responsables de la réalisation de la photosynthèse par la plante. La cellule végétale possède aussi un grosse vacuole qui prend quasiment 90% de l'espace total de la cellule qui  emmagasine ce que la cellule produit en sucres, lipides... La cellule végétale possède aussi une paroi extra-cellulaire beaucoup plus résistance que la membrane des cellules animales, qui délimite les cellules végétales entres-elles mais permettant tout de même une forte communication intra-cellulaire avec de nombreux échanges de molécules.
&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
Je ne vais pas développer ici la cellule bactérienne qui est une structure plus complexe et qui a de nombreuses particularités selon les organismes. Toutefois, il faut signifier que la cellule bactérienne correspond à l'organisme entier puisqu'une bactérie est un être unicellulaire. Ces cellules possèdent donc tout ce qu'il faut comme machinerie de déplacement et d'infection de l'hôte.
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;

&lt;h3&gt;Que fait une cellule (ici animale/végétale)&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Une cellule maintient un ordre dans l'organisme grâce à une gestion de flux très spécifique. Un cellule est un véritable &lt;strong&gt;système thermodynamique&lt;/strong&gt;.
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
Tout d'abord, la cellule est un &lt;strong&gt;espace fermé&lt;/strong&gt; mais qui échange avec l'extérieur. La membrane plasmique est en fait constituée d'une&lt;strong&gt; bicouche phospholipidique&lt;/strong&gt; (des lipides avec &quot;phosphate&quot;), dans laquelle sont enchassées des protéines. Cette membrane filtre les allers et venues des molécules, selon des constances de pH et de concentrations à respecter, et permet le passage de la lumière et de la chaleur. Elle assure aussi la transmission de message (voir le billet sur les &lt;a href=&quot;http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/index.php/post/2008/03/17/Le-theme-de-la-semaine-%3A-Les-neurotransmetteurs&quot; hreflang=&quot;fr&quot;&gt;neurotransmetteurs&lt;/a&gt; et le flux d'informations au niveau neuronal).
&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
De plus, la cellule permet l'expression des gènes aux vues du fait que c'est le noyau qui contient l'ADN. Les étapes biologiquement importants, comme la division cellulaire, permettent la transmission d'un même ADN à plusieurs cellules &quot;filles&quot; issues de la même cellule &quot;mère&quot;. La cellule est vecteur de gènes et vecteur de variation génétique lors de la reproduction sexuée qui consiste à la fusion de 2 cellules ayant des ADN différents.
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;

&lt;h3&gt;En conclusion&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Pour conclure de toute cette étude, la cellule est ce grâce à quoi nous existons. Ces cellules sont toutes plus ou moins autonomes, et pourraient être assimilées à tout un tas de petites machines indépendantes remplissant leur tache pour le bien commun, soit l'organisme entier. &lt;br /&gt;
Les cellules, bien qu'elles soient organisées plus ou moins de manière identique, ont des caractéristiques spécifiques qui font qu'elles ont un rôle spécifique dans l'organisme&amp;nbsp;: un rôle de producteur de matière comme pour la production de bile ou de sucs gastriques (vésicule biliaires, estomac...), un rôle de &quot;nettoyeur&quot; de matière avec la détoxification de l'organisme (foie, rein...) ou encore un rôle mécanique (muscles, coeur, intestin).&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;strong&gt;Toute cellule dans un organisme est importante, et c'est ces petites choses &quot;insignifiantes&quot; qui font ce que nous sommes...&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;</description>
    
    
    
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  <item>
    <title>Le thème de la semaine... : Le système immunitaire</title>
    <link>http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/index.php/post/2008/02/22/Le-theme-de-la-semaine-%3A-Le-systeme-immunitaire</link>
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    <pubDate>Mon, 25 Feb 2008 14:06:00 +0100</pubDate>
    <dc:creator>Evelyne Duvernois</dc:creator>
        <category>Le thème de la semaine...</category>
        <category>biologie</category><category>information scientifique</category><category>progrès scientifique</category><category>thème de la semaine</category>    
    <description>&lt;p&gt;&lt;img src=&quot;http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/public/Logos/LTDS.GIF&quot; alt=&quot;Le thème de la semaine&quot; style=&quot;display:block; margin:0 auto;&quot; /&gt;
Pour notre premier &quot;thème de la semaine&quot;, j'ai décidé en concertation avec vous, de vous parler un peu du système immunitaire. &lt;br /&gt;
Qu'est-ce que c'est&amp;nbsp;? A quoi ça sert&amp;nbsp;?&lt;/p&gt;    &lt;h2&gt;Généralités&lt;/h2&gt;

&lt;p&gt;Le système immunitaire est la barrière que tout organisme a développé pour se protéger des attaques extérieurs. Ce système très sophistiqué permet à l'organisme de combattre tout élément qui lui est inconnu. &lt;br /&gt;
On définit alors le &lt;strong&gt;soi&lt;/strong&gt; du &lt;strong&gt;non-soi&lt;/strong&gt;. On parle du &lt;strong&gt;soi&lt;/strong&gt; pour définir tout élément appartenant à l'organisme, le reste étant du &lt;strong&gt;non-soi&lt;/strong&gt;. Pour reconnaître le soi du non-soi, chaque cellule contient à sa surface des molécules appelées CMH ou &lt;strong&gt;C&lt;/strong&gt;omplexe d'&lt;strong&gt;H&lt;/strong&gt;istocompatibilité &lt;strong&gt;H&lt;/strong&gt;umaine. Ces molécules sont soit reconnues comme du soi, soit comme du non-soi.&lt;br /&gt;
Une reconnaissance de non-soi va déclancher la réponse immunitaire.
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;

&lt;h2&gt;Les agents du système immunitaire&lt;/h2&gt;

&lt;p&gt;Plusieurs éléments de l'organisme sont dédiés à la réponse immunitaire et toutes les molécules et cellules impliquées sont le système immunitaire.&lt;br /&gt;
Les agents principaux et connus de tous sont les &lt;strong&gt;leucocytes&lt;/strong&gt; ou &lt;strong&gt;globules blancs&lt;/strong&gt; qui sont produits dans la moelle osseuse, et sont présentes dans de nombreux endroits du corps (sang, lymphes, ganglions...). Dans le sang, les leucocytes constituent les &lt;em&gt;agents de sécurité&lt;/em&gt; de l'organisme et tente de repérer les intrus. &lt;br /&gt;
Il existe 6 types différents de leucocytes&amp;nbsp;:&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;Les neutrophiles&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: responsables de la défense contre les infections bactériennes et autres petits processus inflammatoires&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;Les éosinophiles&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: gère les infections parasitaires&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;Les basophiles&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: responsable des réponses allergiques&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;Les lymphocytes&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: voir juste après&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;Les monocytes&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: cellule phagocytaire (qui mange &quot;ce qui reste&quot;)&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;Les macrophages&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: monocytes hors du flux sanguin&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;p&gt;&lt;br /&gt;
&lt;img src=&quot;http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/public/th%C3%A8me%20de%20la%20semaine/systeme%20immunitaire/leucocytes.bmp&quot; alt=&quot;leucocytes&quot; style=&quot;display:block; margin:0 auto;&quot; /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
Les  &lt;strong&gt;lymphocytes&lt;/strong&gt; sont le type leucocytaire le plus connu. Ce sont des cellules produites par des cellules souches (cellules non différenciées) dans la moelle osseuse. Une maturation de cellule dans le thymus forment les &lt;strong&gt;lymphocytes T&lt;/strong&gt; tandis que les cellules qui restent dans la moelle donnent des &lt;strong&gt;lymphocytes B&lt;/strong&gt;.&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;


&lt;h2&gt;Qu'est-ce que la réponse immunitaire&amp;nbsp;?&lt;/h2&gt;

&lt;p&gt;Deux types de réponses immunitaires existent&amp;nbsp;:&lt;/p&gt;
&lt;ol&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;La réponse non-spécifique&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: correspond à
&lt;ol&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;une barrière physique&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: le peau ou les muqueuses&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;une réponse des cellules phagocytaires&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: capturant et digérant les intrus&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;une réponse du &lt;em&gt;système du complément&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: qui correspond à un ensemble de protéines qui agissent en cascade (les unes après les autres) dans un processus lytique (provoque la lyse des cellules = éclatement cellulaire).&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;une réponse inflammatoire&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: rougeur, chaleur, douleur, oedème&lt;/li&gt;
&lt;/ol&gt;&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;La réponse spécifique&lt;/strong&gt;: correspond à une spécificité de la réponse = la réponse est dirigée vers un intrus et un seul. Elle est de 2 types&amp;nbsp;:
&lt;ol&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;le système immunitaire &lt;em&gt;humoral&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: qui agit contre les bactéries et virus dans les fluides du corps. Le principal mode d'action est le largage d'&lt;strong&gt;immunoglobulines&lt;/strong&gt; ou plus couramment appelées &lt;strong&gt;anticorps&lt;/strong&gt; produites par des lymphocytes particuliers&amp;nbsp;: &lt;strong&gt;les lymphocytes B&lt;/strong&gt;.&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;le système immunitaire &lt;em&gt;cellulaire&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;: qui agit contre des cellules infectées grâce à l'action des autres lymphocytes&amp;nbsp;: les &lt;strong&gt;lymphocytes T&lt;/strong&gt;.&lt;/li&gt;
&lt;/ol&gt;&lt;/li&gt;
&lt;/ol&gt;
&lt;p&gt;&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;

&lt;h2&gt;Utilité / Nécessité du système immunitaire&lt;/h2&gt;

&lt;p&gt;Le système immunitaire est le mécanisme de défense par excellence de tout être vivant. Il permet de garantir une intégrité dans le matériel génétique (les virus infecte leur ADN dans l'ADN hôte), de garantir une intégrité cellulaire (une cellule infectée est lysée, détruite pour préserver les cellules environnantes) et limiter la prolifération des intrus, donc rendre sain l'organisme. Du simple &quot;bobo sur le genoux&quot; aux grosses maladies infectieuses, le système immunitaire préserve le bon fonctionnement de l'individu.
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;

&lt;h2&gt;Les maladies du système immunitaire&lt;/h2&gt;

&lt;p&gt;Malgré une apparente sophistication du système immunitaire, il apparaît parfois que ce système se &quot;détraque&quot;.
&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
Un problème &quot;bénin&quot; (dans une certaine mesure) du système immunitaire sont les allergies. Une allergie est le résultat d'une réponse immunitaire trop intense contre quelque-chose contre quoi l'organisme ne devrait pas se défendre. L'organisme réagit contre des poussières, du pollen, ou des aliments alors qu'il ne devrait pas.
&lt;br /&gt;
Les petites réactions allergiques que nous connaissons tous ne sont pas graves mais une réaction immunitaire exacerbée peut provoquée un &lt;strong&gt;choc anaphylatique&lt;/strong&gt; pouvant engager le pronostic vital. La réponse provoque le largage de molécules &lt;strong&gt;vaso-actives vasodilatatrices&lt;/strong&gt; (qui dilatent les vaisseaux sanguins) et provoque à terme une chute brutale de la pression artérielle. Cette réaction est provoquée chez une personne &lt;strong&gt;hypersensible&lt;/strong&gt; au 3ème contact avec l'allergène.
&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
Un défaut du système immunitaires est catastrophique pour l'organisme qui ne peut plus se défendre contre ces attaques. C'est l'état dans lequel se trouvent des patients dits &quot;immunodéficients&quot;, par exemple les malades atteints du VIH étant au stade &lt;strong&gt;SIDA&lt;/strong&gt; ou &lt;strong&gt;Syndrome de l'ImmunoDéficience Acquise&lt;/strong&gt;. Ces personnes sont donc très sensibles à des maladies &lt;strong&gt;opportunistes&lt;/strong&gt; c'est-à-dire profitants de l'absence de système immunitaire.
&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
Le système immunitaire peut aussi se retourner contre l'individu lui-même. C'est ce qu'on appelle les &lt;strong&gt;maladies auto_immunes&lt;/strong&gt;, où le système immunitaire s'attaque aux propres cellules de l'organismes (sclérose en plaque, polyarthrite rhumatoïde...).
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;


&lt;h2&gt;Utilisation de ce système en biologie&lt;/h2&gt;

&lt;p&gt;J'expose ici une utilisation particulièrement courante dans tout laboratoire d'analyse appelée &lt;strong&gt;&quot;test par immunofluorescence&quot;&lt;/strong&gt;. Ce test n'est pas le seul utilisant les caractéristiques du système immunitaire mais est très utile pour obtenir des tests simples et peu chères&lt;br /&gt;
Le but est d'avoir des anticorps dirigés contre un certain antigène, c'est-à-dire reconnaissant un certain type de molécules. On met alors en contact l'anticorps avec un fluide quelconque (sang, urine, lymphe...). Le plus souvent, on utilise un second anticorps appelé &lt;strong&gt;anticorps secondaire&lt;/strong&gt; qui reconnaît le 1er anticorps ou &lt;strong&gt;anticorps primaire&lt;/strong&gt;. Cela permet une amplification du signal (plusieurs Ac secondaire sur un seul Ac primaire).&lt;br /&gt;
L'anticorps secondaire est couplé, c'est-à-dire lié chimiquement à une protéines fluorescente. &lt;br /&gt;
Après rinçage, si une fluorescence est observée, cela indique que l'anticorps secondaire a reconnu un anticorps primaire lié à la molécule d'intérêt. Ainsi, la protéine que l'on cherche se trouve bien dans l'échantillon analysé.&lt;br /&gt;
&lt;img src=&quot;http://duvernoisevelyne.blog.rhonealpesjob.com/public/th%C3%A8me%20de%20la%20semaine/systeme%20immunitaire/immunofluorescence.bmp&quot; alt=&quot;IF&quot; style=&quot;display:block; margin:0 auto;&quot; /&gt;
&lt;br /&gt;
Un autre test souvent utilisé aussi est appelé &lt;strong&gt;Elisa&lt;/strong&gt;. La différence ici réside dans le fait qu'on ajoute le fluide sur l'anticorps primaire et qu'on ajoute à nouveau ce même anticorps. Le test &lt;strong&gt;Elisa&lt;/strong&gt; bien connu est le test de grossesse, qui regarde si la protéine HCG est présente ou non dans les urines.
&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;


&lt;h2&gt;Et la prochaine fois...&lt;/h2&gt;

&lt;p&gt;Je vous propose pour la semaine prochaine de continuer sur le système immunitaire et de vous parler de la réponse immunitaire.&lt;br /&gt;
Que se passe-t-il exactement quand l'organisme est attaqué&amp;nbsp;? Qui réagit&amp;nbsp;? Qui fait quoi ?&lt;br /&gt;
Toutefois, si vous avez des idées, n'hésitez pas à m'en faire part...&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
Bonne lecture à tous&amp;nbsp;!&lt;/p&gt;</description>
    
    
    
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