Ingénieur Bioinformaticien... Joli nom mais ça veut dire quoi en réalité ? Voilà ce que je vais tenter d'expliquer dans ce billet...

1. Les compétences requises pour faire un bon bioinformaticien

Je le répète souvent dans mes billets, je considère le métier de bioinformaticien comme appartenant à la grande famille des métiers de la biologie. Il faut ici comprendre que le bioinformaticien est celui qui traite l'information de et pour la biologie.

Il n'est pas, à mon sens, un informaticien au sens où la plupart des gens l'entendent. Ce n'est pas la personne que vous recherchez si vous voulez gérez un réseau intranet ou lui faire faire tout ce qu'un informaticien sait faire. Sa plus-value, sa valeur ajoutée pour parler plus français, c'est de véritablement comprendre la biologie. C'est ce qui fait son intérêt et ce qui mérite d'être souligné dans toute offre d'emploi pour la bioinformatique.

En effet, le monde de la biologie est complexe. Ce n'est pas une matière mais un domaine. J'entends par là que la biologie est vaste et que votre voisin peut être biologiste, sans faire le même travaille que vous. De nombreuses thématiques se mélangent, s'entrechoquent et se rencontrent dans le grand monde de la biologie moderne. C'est cette pluralité inhérente à la biologie qui permet la création d'un nombre de données importants. Le bioinformaticien sert à gérer ces données, c'est son travail et sa particularité.

Ainsi, un bon bioinformaticien est à mon sens une personne qualifiée pour comprendre la biologie, comprendre les divers aspects d'une thématique tout en ayant des connaissances nécessaires dans le domaine de recherche, tout en étant capable de développer les outils logiciels, techniques ou statistiques nécessaires pour étudier correctement les données émises.

2. Capacités informatiques

Le bioinformaticien est un biologiste, je le redis encore une fois (c'est juste histoire que ça rentre ! :) ). Mais quand est-il de ses compétences en informatique ? Je dirais que là, tout dépend de la personne. En effet, on peut se passionner pour la lecture des tutoriaux des langages informatiques ... ou non ! Personnellement, je pense savoir développer dans la mesure de mes compétences. Je suis consciente du fait que certains de mes codes feraient hurler sans doute de véritables informaticiens.
"Ton code n'est pas propre !"... Je n'ai jamais compris comment Monsieur Propre pouvait agir sur un code info... :)

Ceci étant, je suis je pense à même de mener un projet dont la part informatique est grande. Mon travail est de poser les bases, de concrétiser les idées "biologiques" par un développement informatique. Je fais tout pour que mes codes soient "propres" et optimisés à souhait. Toutefois, le monde de la bioinformatique est aussi couvert par de véritables informaticiens de métiers, qui sont charger de véritablement gérer le côté ultra-technique que requiert la biologie.

Ainsi, tout le monde a sa place et nos travaux respectifs sont inter-dépendants !

Pour parler un peu de moi, mes compétences informatiques vont de la création du simple script en langage tel que python au développement d'application standalone en java. Je touche aussi au développement web avec le php et surtout, pour ce qui est de mon travail actuel, je gère des bases de données en postgresql ou mysql. Je "touche" donc à beaucoup de choses et me perfectionne chaque jour !


J'espère que ce billet vous aura éclairer un peu sur ce qui fait mon métier. Je développerai plus tard les aspects plus concrets pour vous, chers lecteurs, concernant la bioinformatique dans le vie de tous les jours, et la description sans doute d'une de mes journées type. Si vous avez des remarques, comme d'habitude, n'hésitez pas !